医学院前身为全国重点中医学校、全国重点中等专业学校、“国家级文明单位”——陕西省中医学校，办学历史可上溯到1965年。2009年，学院在中医学、针灸推拿、中药学专业基础上组建医药系，并于2012年正式更名为医学院。学院目前开设中医学、中药学、针灸推拿、中药制药、中医康复技术、医学美容技术等六个专业。其中，中医学专业是国家级骨干专业、省级一流专业；中药学专业是国家骨干专业、省级一流培育专业。

医学院现有在校生2254人；现有在职教职工65人，其中党员42人，民主党派4人，无党派人士1人，教授人5，副教授17人，具有博士学位的教师7人，具有硕士学位的教师42人；省级教学名师2名；省级优秀教师1名；渭南市中医药教育研究首席专家1名；二级教授1名。

近年来医学院共发表论文25篇（核心13篇、SCI 3篇），专利软著10项，立项课题18项。建有科技创新团队5个、省市级研发中心2个、市级科普教育基地1个，开展技术培训35次，健康与文化服务90余场，惠及群众超2万人次。学生在“挑战杯”“互联网+”等国省级赛事斩获金奖、一等奖等荣誉15项。在人才培养方面，中医定向班24级定向生共65人，其中男生19人、女生46人，团员39人；25级定向生共15人，其中男生3人、女生12人，团员9人，有力支撑我市基层中医药人才培养。

同时，医学院牵头成立陕西省中医药产业产教融合共同体，汇聚成员单位61家。立项建设陕西省中医药虚拟仿真实训基地和渭南职业技术学院乍得国家职业标准互认项目，有力推动中医药文化国际传播。